<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?> 
<!DOCTYPE mml:math PUBLIC "-//W3C//DTD MathML 2.0//EN" 
        "http://www.w3.org/TR/MathML2/dtd/mathml2.dtd" [ 
<!ENTITY % MATHML.prefixed "INCLUDE"> 
<!ENTITY % MATHML.prefix "mml"> 
]> 
<mml:math xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" id="rmsd">



  <mml:mi>RMSD</mml:mi>
  <mml:mo>=</mml:mo>
  <mml:msqrt>
    <mml:mfrac>
      <mml:mn>1</mml:mn>
      <mml:mi>M</mml:mi>
    </mml:mfrac>
    <mml:munder>
      <mml:mo>&Sum;</mml:mo>
      <mml:mi>i</mml:mi>
    </mml:munder>
    <mml:msub>
      <mml:mi>m</mml:mi>
      <mml:mi>i</mml:mi>
    </mml:msub>
    <mml:msup>
      <mml:mrow>
        <mml:mo>&Verbar;</mml:mo>
        <mml:msub>
          <mml:mi>r</mml:mi>
          <mml:mrow>
            <mml:mi>i</mml:mi>
            <mml:mo>,</mml:mo>
            <mml:mn>1</mml:mn>
          </mml:mrow>
        </mml:msub>
        <mml:mo>-</mml:mo>
        <mml:msub>
          <mml:mi>r</mml:mi>
          <mml:mrow>
            <mml:mi>i</mml:mi>
            <mml:mo>,</mml:mo>
            <mml:mn>2</mml:mn>
          </mml:mrow>
        </mml:msub>
        <mml:mo>&Verbar;</mml:mo>
      </mml:mrow>
      <mml:mi>2</mml:mi>
    </mml:msup>
  </mml:msqrt>
</mml:math>
